I 'The Bourne Ultimatum' vender Matt Damon tilbage som Jason Bourne.
Egentlig vil han bare forsvinde fra det hele. Men Jason Bourne er på flugt fra den spionverden, som gjorde ham til den dødsensfarlige superagent, han er. Han har ikke kun mistet sin hukommelse, men også kvinden han elskede.
Med supertrænede snigmordere i hælene og kuglerne flyvende om ørerne, han har nu kun et mål; At vende tilbage til hvor det hele begyndte, og finde ud af hvem han er.
Han rejser fra Moskva, Paris og London til Tanger og New York i jagten på den rigtige Jason Bourne samtidig med, at han forsøger at undslippe politiet, FBI og Interpol agenter.
'The Bourne Ultimatum' er den tredje film i serien efter The Bourne Identity og The Bourne Supremacy.