'I’m Not There' består af en række sideløbende historier som hver især repræsenterer dele af Dylans vidtfavnende personlighed; trubaduren, profeten, den visionære poet, den elektriske Judas, den genfødte prædikant og den ensomme cowboy – alt sammen ledsaget af Dylans udødelige tekster og musik i en collage af sorthvide og farveoptagelser med virkelige og falske nyhedsklip, dokumentariske optagelser, drømmesekvenser og enkelte klip med Dylan selv.
Fælles om at portrættere Bob Dylan er store navne som Christian Bale, Cate Blanchett, Richard Gere, Ben Whishaw og Heath Ledger.